Na samooczyszczanie składają się następujące procesy:
· Rozcieńczanie zanieczyszczeń wodą z odbiornika i mieszanie,
· Sedymentacja zawiesin,
· Adsorpcja,
· Biologiczne usuwanie zanieczyszczeń,
· Wymiana substancji lotnych pomiędzy wodą a atmosferą,
· Wymiana substancji między dnem i wodą.